北京申办研究院，首先要明确研究院的性质，根据研究院的性质不同，需要到相应的部门进行审批。

民办非研究院是经民政局审批的，不能盈利；而企业性质的研究院则是经工商局审批的，可以盈利。

在注册集体所有制研究院时，需要准备以下材料：备选的研究院名称、法人及股东的身份证复印件或扫描件、确认研究院的注册资金及所有股东的出资比例、要求至少两个股东、股东可以是法人，也可以是自然人，承担有限责任。

个人独资研究院只有一个投资人，没有股东，投资人承担无限连带责任。

普通合伙和有限合伙要求股东两个以上，股东可以是法人股，也可以是自然人，承担无限连带责任。

研究院有限公司（有限合伙研究所）要求有两个以上股东，股东可以是法人股或自然人。股份比例最大的股东承担无限连带责任，股份比例小的股东承担有限责任。

注册研究院的行业涵盖教育、农业、医学、中医、信息、工程、科技、科学、能源、电力等。

注册流程包括：确定好要注册的研究院名称及行业等信息，到工商网站申请名称预先核准提交审核，防止被别人使用；通过后到工商局办公窗口现场办理，等待领取营业执照（注意营业执照下发后一定要在规定时间内完成办理，过期作废）；拿到营业执照后要篆刻公章、税务报道、银行开户（正常情况下办完这些手续大约需要10-15个工作日）。